За останні два роки загострилося протистояння між українським державним проєктом Комплексної меморіалізації Бабиного Яру. Протягом 2020 року у ЗМІ з’явилося більш як 200 критичних публікацій на підтримку державного українського проєкту та проти приватного російського проєкту меморіалізації Бабиного Яру. Основні проблеми: можлива участь російської влади під прикриттям меморіального проєкту та намагання російської команди будувати на території кладовищ, зруйнованих совєтською владою.
3-го вересня 2020 року українські євреї звернулися до громадянського суспільства України із закликом рішуче підтримати український проєкт та протистояти російському проєкту «Меморіального центру Голокосту «Бабин Яр», ініційованого і фінансованого російськими мільярдерами, оскільки він стає засобом російської пропаганди в її намаганні дискредитувати Україну в очах світового співтовариства. Вони закликали підтримати розроблений українськими істориками державний проєкт комплексної меморіалізації Бабиного Яру, який прагне гідно вшанувати пам’ять всіх жертв цієї трагічної території. Під згаданим звернення поставили підписи близько 1500 українських євреїв і підтримавших їх представників громадянського суспільства.
У листопаді 2020 року МЦГБЯ виступив з планами будівництва меморіальної синагоги на території Кирилівського православного цвинтаря у Бабиному Яру, що викликало цілком справедливі протести, мета яких не синагога, а провокація російської сторони, яка вже не вперше збуджує міжнаціональні конфлікти в Україні, намагаючись довести всьому світові, що українці – антисеміти. 24-го грудня українські євреї знову звернулися з закликом запобігти будівництву меморіальної синагоги на землі православного кладовища, бо це може привести до провокацій проти України. Під цим зверненням поставлено вже близько 2200 підписів.
